MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Borrelia duttonii Ly plasmid pl11

Total Repeats: 174

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_011224	TAA	2	6	94	99	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_011224	TAT	2	6	107	112	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_011224	AAC	2	6	120	125	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_011224	ATA	2	6	134	139	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_011224	GCA	2	6	161	166	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_011224	TGA	2	6	199	204	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_011224	TAA	2	6	240	245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_011224	ATG	3	9	267	275	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_011224	A	6	6	323	328	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_011224	AGA	2	6	463	468	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_011224	A	6	6	470	475	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_011224	A	6	6	501	506	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_011224	GAA	2	6	539	544	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_011224	ACA	2	6	560	565	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_011224	TTAA	2	8	578	585	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_011224	GAT	2	6	596	601	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
17	NC_011224	ACT	2	6	617	622	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_011224	A	6	6	625	630	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_011224	TTA	2	6	678	683	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_011224	AGT	2	6	686	691	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_011224	AAT	2	6	735	740	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_011224	ATAA	2	8	741	748	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_011224	AT	3	6	749	754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_011224	AG	3	6	781	786	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_011224	TAT	2	6	807	812	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_011224	TAAA	2	8	846	853	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_011224	ATT	2	6	861	866	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_011224	AT	4	8	898	905	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_011224	TAT	3	9	903	911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_011224	ATA	2	6	912	917	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_011224	ATT	2	6	921	926	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_011224	ATA	2	6	946	951	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_011224	AAGG	2	8	957	964	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_011224	TAAAA	2	10	1827	1836	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_011224	AG	3	6	1861	1866	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_011224	T	6	6	1875	1880	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_011224	CT	3	6	1881	1886	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_011224	AT	3	6	1952	1957	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_011224	TA	3	6	1963	1968	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_011224	T	7	7	1976	1982	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_011224	ATA	2	6	2001	2006	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_011224	TA	3	6	2015	2020	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_011224	TTA	2	6	2042	2047	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_011224	ATATT	2	10	2049	2058	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_011224	ACAA	2	8	2107	2114	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
46	NC_011224	TCA	2	6	2215	2220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_011224	TAA	2	6	2223	2228	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_011224	ATT	2	6	2230	2235	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_011224	ACA	2	6	3277	3282	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_011224	ATA	2	6	3290	3295	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_011224	ATATTA	2	12	3306	3317	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_011224	AT	3	6	3323	3328	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_011224	T	6	6	3357	3362	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_011224	A	6	6	3372	3377	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_011224	ATT	2	6	3393	3398	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_011224	TAT	2	6	3406	3411	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_011224	TAA	3	9	3438	3446	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_011224	CAT	2	6	3474	3479	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_011224	ATA	2	6	3480	3485	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_011224	ATT	2	6	3488	3493	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_011224	TAA	2	6	3533	3538	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_011224	TTATA	2	10	3539	3548	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_011224	T	7	7	3550	3556	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_011224	T	6	6	3558	3563	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_011224	TAATT	2	10	3565	3574	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_011224	TAG	2	6	3580	3585	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_011224	TAA	2	6	3597	3602	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_011224	A	8	8	3605	3612	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_011224	AT	4	8	3624	3631	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_011224	CAT	3	9	3663	3671	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_011224	ATT	2	6	3724	3729	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_011224	TAGT	2	8	3731	3738	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_011224	AAGT	2	8	3760	3767	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_011224	T	6	6	3806	3811	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_011224	ATT	2	6	3817	3822	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_011224	GAT	2	6	3828	3833	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_011224	TTTA	2	8	3838	3845	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_011224	T	6	6	3863	3868	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_011224	TA	3	6	3909	3914	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_011224	TTGA	2	8	3967	3974	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_011224	TTTTG	2	10	3999	4008	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
82	NC_011224	ATCT	2	8	4021	4028	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
83	NC_011224	A	6	6	4067	4072	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_011224	ATT	2	6	4089	4094	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_011224	AAT	2	6	4096	4101	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_011224	TA	3	6	4109	4114	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_011224	AATT	2	8	4136	4143	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_011224	TAA	2	6	4171	4176	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_011224	TAT	2	6	4184	4189	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_011224	TAA	2	6	4207	4212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_011224	ATTT	2	8	4213	4220	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_011224	ATA	2	6	4230	4235	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_011224	AAT	2	6	4236	4241	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_011224	AT	3	6	4285	4290	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_011224	ATAAAA	2	12	4296	4307	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_011224	CCA	2	6	4314	4319	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_011224	T	9	9	4336	4344	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_011224	TATT	2	8	4361	4368	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_011224	TTTATA	2	12	4408	4419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_011224	ATT	2	6	4505	4510	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_011224	TTA	2	6	4513	4518	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_011224	TAA	2	6	4525	4530	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_011224	TA	3	6	4540	4545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
104	NC_011224	ATT	2	6	4578	4583	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_011224	AAC	2	6	4591	4596	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_011224	TTTAA	2	10	4616	4625	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_011224	AT	3	6	4656	4661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_011224	A	7	7	4676	4682	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_011224	GGT	2	6	4731	4736	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
110	NC_011224	TAT	2	6	4755	4760	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_011224	ATA	2	6	4767	4772	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_011224	TAAAAT	2	12	4808	4819	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_011224	ATA	2	6	4823	4828	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_011224	ATT	2	6	4832	4837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_011224	ATA	3	9	4862	4870	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_011224	A	6	6	4870	4875	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_011224	TA	3	6	4884	4889	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_011224	CT	3	6	4954	4959	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_011224	TA	3	6	4960	4965	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_011224	ACT	2	6	5832	5837	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_011224	ATC	2	6	5851	5856	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_011224	AT	3	6	5859	5864	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_011224	ATT	3	9	5882	5890	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_011224	ATT	2	6	5902	5907	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_011224	AT	3	6	5913	5918	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_011224	ATT	2	6	5963	5968	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_011224	TAT	2	6	5992	5997	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_011224	T	6	6	5997	6002	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_011224	AAC	2	6	6010	6015	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_011224	TAT	2	6	6021	6026	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_011224	ATC	2	6	6033	6038	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_011224	AT	3	6	6942	6947	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_011224	TA	3	6	6953	6958	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_011224	T	7	7	6971	6977	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_011224	A	7	7	6981	6987	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_011224	AATTT	2	10	6999	7008	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_011224	ATT	2	6	7029	7034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
138	NC_011224	ATT	2	6	7036	7041	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_011224	ATTA	2	8	7052	7059	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
140	NC_011224	AAT	2	6	7097	7102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_011224	ATA	2	6	7120	7125	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_011224	A	6	6	7938	7943	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_011224	T	6	6	7976	7981	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
144	NC_011224	ATA	2	6	7991	7996	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_011224	TAA	2	6	8008	8013	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
146	NC_011224	ATT	2	6	8025	8030	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
147	NC_011224	ATT	2	6	8050	8055	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_011224	T	6	6	8064	8069	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
149	NC_011224	AAT	2	6	8095	8100	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
150	NC_011224	ATTT	2	8	8108	8115	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
151	NC_011224	TA	3	6	8136	8141	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_011224	ATT	2	6	8152	8157	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_011224	A	7	7	9118	9124	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
154	NC_011224	ATT	2	6	9142	9147	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
155	NC_011224	TCT	2	6	9174	9179	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
156	NC_011224	CT	3	6	9193	9198	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
157	NC_011224	AAG	2	6	9211	9216	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
158	NC_011224	TA	3	6	9244	9249	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
159	NC_011224	AAGTA	2	10	9255	9264	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
160	NC_011224	ATGGT	2	10	9270	9279	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
161	NC_011224	AGA	2	6	9280	9285	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
162	NC_011224	AGT	2	6	9295	9300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
163	NC_011224	GTA	2	6	9314	9319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
164	NC_011224	TAT	2	6	9331	9336	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_011224	TGA	2	6	9358	9363	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
166	NC_011224	T	6	6	9371	9376	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
167	NC_011224	T	6	6	9437	9442	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_011224	ATT	2	6	9459	9464	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
169	NC_011224	TAT	2	6	9467	9472	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_011224	T	6	6	9475	9480	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
171	NC_011224	T	6	6	9543	9548	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
172	NC_011224	TAA	2	6	9626	9631	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
173	NC_011224	T	7	7	10319	10325	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
174	NC_011224	GA	3	6	10375	10380	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.